De dagelijkse leiding is in handen van de directeur. De team manager ondersteunt de directeur in zijn opdracht en vervangt de directeur in diens afwezigheid. De directeur en team manager worden voor de verschillende activiteiten van EURIDICE ondersteund door de coördinator RD&D, de verantwoordelijke Exploitatie & Veiligheid en de coördinator Communicatie.
Beide leden van EURIDICE, SCK CEN en NIRAS, besturen samen EURIDICE vanuit het College van Zaakvoerders (CVZ). De directeur en team manager van EURIDICE rapporteren aan het CVZ en nemen deel aan de vergaderingen met raadgevende stem. De leden van het CVZ voor de periode juni 2021 - juni 2025:
Drie overlegorganen adviseren het bestuurscomité en ondersteunen EURIDICE in haar activiteiten:
EURIDICE heeft geen eigen personeel. Naast de directeur, die wordt aangesteld door NIRAS, behoren de meeste teamleden tot het personeel van SCK CEN. De organisatienota omschrijft de opdrachten en rollen van het ingezet personeel met het oog op een geïntegreerde en gecoördineerde samenwerking. Samen vormen ze het EURIDICE-team dat uit een 15-tal personen bestaat.